医疗器械注册的费用因国家、地区、产品类型、代办公司和申请流程的复杂性而异。针对LED光子治疗仪二类医疗器械的注册，费用会因多种因素而有所不同。一般来说，费用可能包括以下方面：

技术文件准备和审核费用：涉及产品的技术文件、质量管理体系文件的准备和审核。

代理公司服务费：委托医疗器械代理公司进行注册可能会产生服务费用。这些费用会根据代办公司的水平、经验、服务范围和所提供的支持而有所不同。

申请费：有些国家或地区可能要求支付申请费用，用于处理注册申请。

审查费：监管机构对注册申请进行审查和评估可能收取审查费用。

其他成本：例如临床试验、生产设备和工艺调整等可能涉及的其他费用。

由于医疗器械注册的费用因多种因素而异，好向多家代办公司咨询，了解他们的服务费用以及整个注册过程中可能产生的其他费用。这样可以更清楚地了解注册过程的总体成本，并选择适合您需求和预算的服务提供商。