对于代办三类进口医疗器械冠状动脉功能测量系统产品的注册，通常需要完成以下步骤和流程：

申请准备： 准备完整的技术文件，包括产品的设计图纸、技术规格、工艺流程、质量控制计划、生产设备清单、质量管理体系文件等。

合作厂商选择： 选择符合要求、有能力生产冠状动脉功能测量系统产品的国内合作厂商，并确保其生产条件和质量管理体系符合要求。

现场审核和检查： 对合作厂商进行现场审核和检查，确保其生产环境、设备和工艺满足医疗器械生产的要求，并符合国家药监部门的标准。

提交申请和审批流程： 通过国家药监部门正式提交注册申请，包括技术文件、审核报告、现场检查记录等，并按流程进行审批。

技术评估和审查： 国家药监部门可能会对申请的技术文件进行评估和审查，确保其符合规定和标准。

注册证获批和颁发： 完成审批程序后，如果符合要求，药监部门会颁发三类医疗器械注册证，允许生产和销售冠状动脉功能测量系统产品。

遵守监管要求： 获得注册证后，生产厂商需要遵守相关的监管要求和标准，包括质量控制、产品监管、定期审计等。

这个注册流程需要严格遵循中国国家药品监督管理局（NMPA）的相关规定和流程。注册代办通常由的代办机构或律师事务所等机构来完成，他们具备相关经验和知识，能够帮助申请人顺利完成整个注册流程。因此，选择合适的代办机构非常重要，需要考虑其性、经验和服务质量。