医疗器械磁共振成像系统产品的经营许可证办理流程一般如下：

1. 准备资料：

企业资质文件： 包括企业营业执照、组织机构代码证等公司基本资质文件。

产品质量管理文件： 涉及产品质量管理、生产环境、生产工艺流程等的相关文件。

经营范围申请文件： 确保经营范围包含磁共振成像系统等医疗器械产品。

其他相关文件： 与经营许可证申请有关的文件资料。

2. 咨询了解要求：

了解相关法规和标准： 熟悉国家药监局或相关部门对于磁共振成像系统产品经营许可的要求和标准。

咨询机构： 与医疗器械注册代办公司或相关部门咨询，了解详细的办理流程和要求。

3. 递交申请：

递交申请材料： 将准备好的资料递交给相关部门（例如国家药监局）或当地的行政管理部门。

缴纳申请费用： 根据要求缴纳相关的申请费用。

4. 审核和评估：

资料审核： 相关部门对申请资料进行审核，确保资料完整、准确。

现场审查（可能性）： 针对特定情况或产品，可能进行现场审查，验证企业的经营和管理情况。

5. 补充和响应：

补充材料： 如有要求，及时补充和提供相关的文件或信息。

响应相关问题： 如有审查中的问题或需要提供额外信息，及时响应和配合。

6. 审批和获证：

审批流程： 相关部门进行审批和评估，确认符合要求后，决定是否颁发经营许可证。

获证： 若申请通过审批，将获得医疗器械经营许可证，允许经营磁共振成像系统产品。

办理经营许可证的具体流程和时间可能因地区、相关部门的流程等因素有所不同。因此，在办理过程中与相关部门保持沟通，了解具体的进展情况并及时处理所需的文件和信息。