企业生产医疗器械强脉冲光治疗仪的CE认证流程如下：

准备证明文件：企业需要准备医疗器械强脉冲光治疗仪的产品清单、产品说明、工作原理等证明文件，并确保这些文件符合欧盟的医疗器械指令或规例要求。

选择认证机构并申请认证：企业需要选择一个被欧盟认可的认证机构，如CE认证机构，并提交所有必要的证明文件。认证机构将进行审核和测试，以确定产品是否符合CE认证的所有标准。

通过CE认证：如果产品符合CE认证的标准，企业将获得CE认证证书，并可以在欧洲市场上销售该产品。

需要注意的是，CE认证是欧盟对医疗器械产品的基本安全要求，只有获得CE认证证书的产品才能在欧洲市场上销售。此外，企业还需要建立完善的质量管理体系，以确保产品的安全性和有效性。在申请CE认证前，建议企业与机构或咨询公司进行深入的沟通和咨询，以确保准确了解和满足CE认证的要求。