医疗器械彩色超声多普勒诊断系统产品经营许可证的办理流程通常涉及以下几个主要步骤：

准备申请材料：

首先，申请人需要准备完整的申请材料，包括《医疗器械经营企业许可证申请表》、《医疗器械经营企业许可证》、申请报告等。

同时，还需要提供经营场地、仓库场所的证明文件，如房产证明或租赁协议等。

拟办法定负责人、企业负责人、质量管理人的身份证、学历证明或职称证明的复印件及个人简历也需要一并提交。

此外，申请人还需提供技术人员一览表及学历、职称证书复印件，以及经营质量管理规范文件目录等。

提交申请：

将准备好的申请材料提交给食品药品监督管理部门。通常，这需要在线提交申请材料，并预约相关部门对经营场地进行实地查看。

审核与审批：

食品药品监督管理部门会对提交的申请材料进行审核，包括材料的真实性和完整性等。

审核通过后，会进行现场审核，由审核员到企业经营场所进行实地检查，确保符合相关要求。

发放证书：

如果申请通过审核，食品药品监督管理部门会发放医疗器械经营许可证。

该证书会在相关网站上进行公示，无异议后，通知企业领取医疗器械经营许可证。

请注意，上述流程可能因地区和具体规定而有所不同。在办理经营许可证之前，建议申请人详细查阅所在地的食品药品监督管理部门发布的新规定和流程，确保按照要求准备和提交申请材料。同时，申请人也应注意遵守相关法律法规，确保经营活动的合法性和安全性。