申请在印度尼西亚注册超声治疗仪的流程和费用可能会有所不同，因为具体的要求可能会随时间和规定的变化而变化。但一般来说，以下是通常的注册流程和一般的费用考虑因素：

1. 准备文件和资料：首先，需要准备相关文件和资料，包括产品说明书、技术规格、质量管理体系文件、生产工艺等。这些文件需要符合印度尼西亚当地FDA的要求。

2. 申请：提交申请，可能需要填写申请表格并提交必要的文件和资料。这个过程可能需要一定的时间来处理。

3. 评审：的申请将会经过审查和评估，以产品符合卫生和安全标准。

4. 审核：审核可能包括现场检查，以确认生产过程和设施符合要求。

5. 批准：如果的产品符合要求，将获得印度尼西亚FDA的注册批准。

费用方面，注册费用可能会因产品类型、申请复杂性和其他因素而有所不同。一般来说，费用可能包括申请费、文件准备费用、审核费用等。此外，还要考虑到可能的咨询费用或代理费用，如果选择委托或代理来处理注册事务的话。

较好的做法是与当地的FDA或者咨询公司联系，以获取较准确的信息和具体的费用估算。他们可以为提供详细的指导，并且帮助了解整个注册流程的时间和费用方面的情况。