申请在印度尼西亚注册超声治疗仪需要提交一系列证明文件和质量计划。以下是可能需要的文件和计划：

1. 产品注册申请表： 提供详细的产品信息，包括技术规格、使用说明等。
   
2. 技术文件： 包括产品技术规格、设计图纸、技术说明书等。

3. 质量管理体系文件： 包括质量管理手册、程序文件、记录文件等。

4. GMP证书： 证明生产过程符合卫生和质量管理规范的证书。

5. ISO认证： 证明公司符合ISO组织的相关标准的证书，如ISO 13485（医疗器械质量管理体系标准）。

6. 产品安全性和有效性数据： 包括临床试验数据、实验室测试报告等，证明产品安全、有效。

7. 注册申请费用： 缴纳注册申请所需的费用。

8. 其他文件： 可能需要根据印度尼西亚FDA的具体要求提供其他文件。

在提交这些文件之前，较好先仔细了解印度尼西亚FDA的具体要求和流程，以申请顺利进行。