每个国家或地区的医疗器械注册流程和要求可能会有所不同。因此，射频消融发生器申请印度尼西亚FDA注册是否有地区差异取决于印度尼西亚的具体法规和要求。通常情况下，申请注册医疗器械需要提供相关的技术文件、临床试验数据、质量管理体系文件等。建议直接咨询印度尼西亚FDA或当地的医疗器械注册专家以获取较准确的信息。