申请射频消融发生器在印度尼西亚FDA注册通常需要提交一系列文件和证明材料。以下是可能需要准备的一些文件和程序：

1. 产品注册申请表: 这是提交给印度尼西亚FDA的标准表格，包括产品的基本信息、制造商信息等。

2. 产品说明书: 包括产品的技术规格、使用说明、安全注意事项等详细信息。

3. 质量管理体系文件: 包括质量管理手册、质量控制程序、内部审计程序等文件，证明产品的生产过程受到严格的管理和监控。

4. 生产许可证明: 证明生产厂家具备符合的生产能力和条件。

5. 产品检测报告: 包括产品的安全性、性能等方面的检测报告，通常由合适的测试出具。

6. ISO认证: 如果产品所在企业已经取得ISO 13485质量管理体系认证，应提供相关证明文件。

7. 注册代理授权文件: 如果申请人不是印度尼西亚境内企业，可能需要委托当地代理进行注册申请，并提供相应的授权文件。

8. 其他证明文件: 根据印度尼西亚FDA的具体要求，可能还需要提供其他文件，例如符合印度尼西亚相关法规的证明文件等。

在准备这些文件时，建议与当地的注册顾问或律师联系，以文件的准备和提交符合印度尼西亚FDA的要求。