在申请印度尼西亚临床试验合同研究组织（CRO）服务注册时，以下是所需的证明文件和质量控制计划的详细清单：

申请表格：完整填写并签署的申请表格。

公司注册证明：包括公司的营业执照、成立证书和税务登记证。

公司简介：包括公司概述、主要业务范围和服务类型。

GMP/GCP证书：提供良好生产规范（GMP）和良好临床规范（GCP）的证书，确保符合。

营业执照：公司在印度尼西亚的营业执照。

组织架构图：详细描述公司内部结构及各部门的职责。

人员资格证明：包括关键人员的简历、学术资格证书和相关工作经验证明。

财务报告：近一年的财务报告和审计报告。

合同和协议：与其他相关机构（如医院、实验室等）签署的合同和合作协议。

合规声明：声明公司遵守所有相关法律法规和行业标准。

质量手册：描述CRO的质量管理体系，包括质量方针、目标和质量管理的总体框架。

标准操作程序（SOPs）：详细描述所有关键操作流程，包括但不限于：

临床试验的启动、监查和关闭程序

数据管理和统计分析程序

药物警戒和安全报告程序

项目管理和沟通程序

风险管理计划：识别、评估和控制临床试验过程中可能出现的风险的详细计划。

监查计划：针对临床试验的监查策略，包括监查频率、方法和报告机制。

培训计划：对所有参与人员进行定期培训的计划，确保他们熟悉新的法规和操作流程。

质量审计计划：定期审计质量管理体系和临床试验的实施情况，以确保符合相关标准。

纠正和预防措施（CAPA）计划：描述如何处理和预防发现的问题和偏差。

文件管理计划：确保所有文件的创建、审核、批准、分发、修订和存档符合规范的管理计划。

临床试验主文件（TMF）管理：管理和维护临床试验主文件的程序，确保所有关键文件的完整性和可追溯性。

安全管理计划：确保受试者安全的管理程序，包括不良事件的监测和报告流程。

这些文件和计划是确保CRO在印度尼西亚能够合法合规地运营并提供高质量服务的基础。具体要求可能会因项目和主管机构的不同而有所变化，建议在提交申请前仔细查阅相关法规或咨询机构以确保准备充分。