申请超声骨组织手术系统在澳大利亚注册时，需要提供一系列的证明文件和质量管理程序文件，以产品符合澳大利亚的法规和标准要求。以下是可能需要提供的文件：

产品注册申请文件：

包括对产品的描述、技术规格、性能特点、预期用途等信息，以及相关的技术文件和测试报告。

ISO 13485质量管理体系认证证书：

证明制造商的质量管理体系符合ISO 13485标准的认证证书。

医疗器械生产许可证：

如果适用，提供制造商的医疗器械生产许可证或类似许可证。

生产设施合规性证明：

提供生产设施的合规性证明，包括建筑许可证、环境保护许可证等。

原材料和零部件供应商质量保障书：

提供原材料和零部件供应商的质量保障书，证明原材料和零部件符合质量要求。

设计控制程序文件：

描述产品设计和开发过程的管理控制程序，产品设计符合预期用途和性能要求，并满足患者需求和临床要求。

购买控制程序文件：

管理购买过程的程序，从供应商获得的原材料和零部件符合质量要求和标准。

生产控制程序文件：

管理产品生产过程的程序，包括设备校准、生产操作、工艺控制、生产记录等。

检验和测试控制程序文件：

管理产品检验和测试过程的程序，产品符合规格和标准要求。

负面品处理程序文件：

描述负面品的识别、记录、处理和纠正措施的程序，负面品不会流入市场或影响产品质量。

以上是可能需要提供的证明文件和质量管理程序文件，具体要求可能会根据澳大利亚治疗用品管理局（TGA）的要求和产品的特点而有所不同。制造商需要根据实际情况进行准备，并文件的准确性和完整性。