内窥镜血管吻合器在申请英国注册时，需要准备的质量管理手册和程序文件是产品符合英国医疗器械法规要求的重要组成部分。这些文件通常包括以下几个方面：

质量管理手册是组织质量管理的纲领性文件，它系统地描述了组织的质量管理体系，包括质量方针、质量目标、组织结构、职责分配、程序文件等内容。对于内窥镜血管吻合器的制造商而言，质量管理手册应明确以下内容：

质量方针：阐述组织对质量管理的总体方向和承诺。

质量目标：设定可量化的质量目标，以支持质量方针的实现。

组织结构：描述组织的质量管理架构，包括各部门和岗位的职责分配。

质量管理体系要求：概述组织如何满足ISO 13485等的要求，以及英国医疗器械法规的特定要求。

程序文件是质量管理手册的支持性文件，它详细描述了质量管理体系中各项活动的具体步骤、方法和要求。对于内窥镜血管吻合器的制造商而言，通常需要准备以下程序文件：

文件控制程序：规定文件的编制、审核、批准、发放、修改、作废等控制要求，以文件的准确性和有效性。

记录控制程序：规定记录的标识、贮存、保护、检索、保留和处置等控制要求，以记录的完整性和可追溯性。

管理评审程序：规定管理评审的时机、方法、输入、输出和后续措施等要求，以质量管理体系的持续适宜性、充分性和有效性。

内部审核程序：规定内部审核的策划、实施、报告和纠正措施等要求，以验证质量管理体系的运行情况并发现改进机会。

风险管理程序：规定风险管理的过程和方法，包括风险识别、风险评估、风险控制和风险评审等步骤，以产品在整个生命周期内的风险得到有效控制。

设计和开发控制程序：规定产品设计和开发的策划、输入、输出、评审、验证、确认和更改等控制要求，以产品设计满足预期用途和法规要求。

购买控制程序：规定购买过程的控制要求，包括供应商的选择、评价和再评价，以及购买信息的确定和购买产品的验证等，以购买的产品符合规定要求。

生产和服务提供控制程序：规定生产和服务提供过程的控制要求，包括生产环境的控制、生产设备的维护、生产过程的监控和测量、产品的标识和可追溯性等，以产品符合规定要求。

不合格品控制程序：规定不合格品的标识、隔离、评审、处置和记录等控制要求，以防止不合格品的非预期使用或交付。

此外，根据内窥镜血管吻合器的具体特点和英国医疗器械法规的特定要求，制造商还可能需要准备其他相关的程序文件，如清洁和消毒程序、灭菌验证程序、生物相容性评估程序等。

请注意，以上内容仅为一般性指导，具体要求可能因产品特性和法规变化而有所不同。因此，在准备质量管理手册和程序文件时，制造商应仔细研究英国医疗器械法规和相关标准的要求，并咨询的医疗器械法规顾问或认证以文件的合规性和有效性。