在手术导航系统申请香港注册的过程中，一般不需要提供生产设施合规性报告。通常情况下，注册申请主要关注产品本身的质量、性能、安全性和符合性，以及生产制造过程的质量管理体系。

生产设施合规性报告主要用于证明生产设施符合相关的法规和标准要求，通常是在生产设施进行年度审核时提供的。这种报告可能包括对生产设施的设施条件、设备设施、卫生条件等方面的评估。如果注册在审核过程中认为有必要对生产设施进行审核或评估，可能会要求申请者提供相关的生产设施合规性报告或证明文件。这通常会在注册与申请者进行沟通时提出，并根据具体情况而定。

因此，虽然一般情况下不需要提供生产设施合规性报告，但在与注册的沟通中，申请者仍需要根据注册的要求提供相关的文件或证明以支持注册申请。