手术导航系统申请香港注册时，需要准备一系列证明文件和质量计划，以产品的合规性和质量。以下是需要的主要证明文件和质量计划：

质量管理体系符合性证明：

提供符合ISO 13485或其他认可的质量管理体系标准的证书，证明企业的质量管理体系得到有效实施和维护。

CE证书或等效的国际认证：

如果手术导航系统已在欧盟或其他国际市场获得CE认证或等效的国际认证，应提供相关证书，以证明产品符合和要求。

原产国注册证明（如适用）：

如果手术导航系统已在原产国获得注册，应提供注册证明文件，以加速在香港的注册流程。

供应商资质证明：

提供关键原材料和零部件供应商的资质证明，包括供应商的质量管理体系证书、生产许可证等。

标签和使用说明：

提供符合香港法规和标准要求的标签和使用说明，信息的准确性和完整性。

质量控制计划：

详细描述手术导航系统在设计和生产过程中的质量控制措施，包括原材料检验、生产过程控制、成品检验等。

风险管理计划：

制定风险管理计划，识别、评估和控制与手术导航系统相关的风险，产品的安全性和可靠性。

临床评估计划：

如果需要进行临床试验，应制定临床评估计划，明确临床试验的目的、方法、样本量等，以评估产品的安全性和有效性。

持续改进计划：

制定持续改进计划，通过定期的内部审核、管理评审和数据分析，不断优化质量管理体系和产品设计，提高产品质量和客户满意度。

上市后监督计划：

制定上市后监督计划，包括负 面事件报告、产品召回、纠正和预防措施等，以产品在市场上的安全性和有效性。

在准备这些证明文件和质量计划时，企业应参考香港特别行政区管理部门卫生署医疗器械科（MDD）的注册要求和指南，文件符合相关法规和标准的要求。同时，企业还应与注册保持密切沟通，及时解答疑问或提供补充材料，以注册申请的顺利进行。此外，根据香港MDD的具体要求，可能还需要提供其他额外的证明文件或质量计划。