手术导航系统出口泰国需要办理的认证主要是泰国医疗器械注册认证，由泰国食品和药物管理局（Thai Food and Drug Administration，简称TFDA）负责。以下是关于该认证的详细办理流程：

需要在泰国市场上销售或分销的医疗器械，必须向TFDA提交注册申请，并提供必要的技术文件和其他相关信息。

注册过程可能包括文件审核、现场审核和实验室测试等步骤。

准备文件

申请者必须准备申请所需文件，包括产品注册申请表、产品说明书和标签、产品规格、成分和制造工艺的详细说明、制造厂商的注册证明和质量管理体系文件、产品的安全性和有效性证明文件等。

申请者需要自由销售证明和/或质量体系证明符合所有必需标准。

提交申请

将准备好的文件和申请表提交给泰国FDA服务中心。

文件评审

TFDA将对提交的文件进行评审和审查，文件的完整性和符合泰国相关法规和要求。

技术评估

根据需要，TFDA可能会要求进行技术评估，包括产品的质量和安全性评估等。申请者可能需要提供进一步的技术文件和证明材料。

审批和注册

如果申请文件符合要求并通过了评估，TFDA将核准产品并颁发认证证书。产品将被注册为合法的医疗器械，可以在泰国市场上销售和使用。

注册证必须由泰国医疗器械进口证的公司持有。

申请者须有完善的产品贮存计划，包括指示放置医疗器械的存放地点内部平面图，并详细说明仓储空间的空间分配、存储设施安装，以及减低存货对个人和公共健康的方案。

医疗器械在进入泰国之前需要有生产过的医疗器械注册证明。非泰国本地生产的医疗器械产品很难单靠在其他国家的医疗器械注册认证进行泰国FDA认证。

如果设备不完整或不符合TFDA规定，则监管有权要求进行修订或提供其他文件。申请者必须修改并重新提交其申请。

整个注册过程可能需要3到6个月的时间才能获得批准，具体取决于制造商医疗器械的产品等级和所参阅法规的要求。

综上所述，手术导航系统出口泰国需要办理泰国医疗器械注册认证，并按照上述步骤进行申请。为产品顺利进入泰国市场，建议出口商提前了解并准备相关认证文件和技术资料。