外科超声手术系统申请澳大利亚注册时，确实需要提供生产设施合规性报告。这是根据澳大利亚治疗用品管理局（TGA）的医疗器械注册要求来确定的。

生产设施合规性报告是制造商证明其生产设施符合澳大利亚相关法规和标准的重要文件。该报告应详细阐述生产设施的设计、布局、设备配置、人员培训、质量管理体系等方面的情况，并证明这些方面均符合澳大利亚的法规要求。

在准备生产设施合规性报告时，制造商需要关注以下几个方面：

质量管理体系：制造商应建立并执行符合ISO 13485等的质量管理体系，产品的设计、生产、检验和放行等环节均符合法规要求。

生产设施和环境：生产设施应具备良好的生产环境，包括洁净车间、温湿度控制、防尘防虫等措施。同时，生产设施还应符合相关的电气安全和机械安全标准。

设备和工艺：制造商应提供用于生产外科超声手术系统的设备和工艺的详细信息，并证明这些设备和工艺符合澳大利亚的法规要求。此外，制造商还应定期对设备和工艺进行维护和验证，以其稳定性和可靠性。

人员培训和管理：制造商应生产人员具备相关的知识和技能，并接受过必要的培训。同时，制造商还应建立有效的人员管理制度，包括人员招聘、培训、考核和奖惩等方面。

在提交注册申请时，制造商需要将生产设施合规性报告作为申请材料的一部分进行提交。TGA将对报告进行审查，以评估生产设施是否符合澳大利亚的法规要求。如果审查通过，TGA将颁发注册证书，允许制造商在澳大利亚市场上销售外科超声手术系统。

因此，对于外科超声手术系统申请澳大利亚注册的情况，制造商应准备完整和准确的生产设施合规性报告，并按照TGA的要求进行提交。