手术导航系统申请香港注册时，确实需要提供产品的医学合规性报告。医学合规性报告是医疗器械注册申请中的重要组成部分，它用于证明产品符合相关的医学标准和法规要求。以下是关于手术导航系统申请香港注册时医学合规性报告的详细解释：

医学合规性报告是评估医疗器械安全性和有效性的关键文件之一。它涵盖了产品的设计、制造、性能、生物相容性、电磁兼容性等多个方面，产品符合香港特别行政区管理部门卫生署医疗器械科（MDD）的注册要求和标准。通过提供医学合规性报告，申请者可以向MDD证明其手术导航系统已经经过了严格的测试和评估，并符合相关的医学标准和法规要求。

医学合规性报告通常包括以下几个方面的内容：

产品概述：简要介绍手术导航系统的功能、用途、结构和工作原理等。

设计和制造要求：说明产品在设计和制造过程中遵循的法规和标准，如ISO 13485质量管理体系标准等。

性能评估：提供手术导航系统的性能测试结果，包括准确性、可靠性、稳定性等方面的数据。

生物相容性评估：评估手术导航系统与人体组织的相容性，产品在使用过程中不会对人体造成危害。

电磁兼容性评估：对于涉及电子或电气部分的手术导航系统，需要提供电磁兼容性测试报告，以设备在各种环境下的稳定性和安全性。

风险评估：对手术导航系统进行风险评估，识别潜在的安全隐患，并提出相应的风险控制措施。

为了准备一份符合MDD要求的医学合规性报告，申请者可以采取以下步骤：

了解相关法规和标准：深入研究香港关于医疗器械注册的法规和标准，报告内容符合MDD的要求。

选择具备资质的测试：选择具备相应资质和认证的测试进行性能测试、生物相容性评估和电磁兼容性测试等。

整理和分析测试数据：收集测试提供的测试数据，并进行整理和分析，数据的准确性和可靠性。

编写报告：根据MDD的要求和格式，编写医学合规性报告，内容完整、清晰、准确。

审核和修改：在提交前，对报告进行审核和修改，所有信息都符合MDD的要求和标准。

综上所述，手术导航系统申请香港注册时，需要提供产品的医学合规性报告。申请者应深入了解相关法规和标准，选择具备资质的测试进行测试，并认真编写和审核报告内容，以报告的准确性和合规性。