医疗器械生产企业确保支气管CT影像处理软件的用户隐私保护，可以采取以下措施：

1. 收集用户信息时的隐私保护：

2. 在收集用户信息时，应明确告知用户信息的收集目的、使用方式和范围，并获得用户的明确同意[1]。

3. 只收集必要的信息，避免过度收集用户的个人数据[1]。

4. 加强数据加密与安全存储：

5. 使用高强度的加密算法对用户数据进行加密，确保数据在传输和存储过程中的安全性[1]。

6. 对存储的用户数据进行定期备份，以防止数据丢失，并确保备份数据的安全性[1]。

7. 严格管理用户数据访问权限：

8. 限制员工和第三方对用户数据的访问权限，确保只有授权人员才能访问用户数据[1]。

9. 定期进行权限审查，及时撤销不再需要的访问权限[1]。

10. 合规使用用户数据：

11. 仅在用户同意的范围内使用用户数据，不得将数据用于其他未经用户同意的目的[1]。

12. 避免将用户数据泄露给第三方，除非得到用户的明确授权或法律要求[1]。

13. 建立隐私政策和数据保护制度：

14. 制定详细的隐私政策，明确说明企业如何收集、使用和保护用户数据，以及用户在隐私保护方面的权利和责任[1]。

15. 定期对隐私政策和数据保护制度进行审查和更新，以确保其符合法律法规的要求和用户的期望[1]。

16. 加强员工培训和意识提升：

17. 对员工进行隐私保护和数据安全的培训，提高员工对隐私保护重要性的认识[2]。

18. 培养员工的安全意识，确保他们在处理用户数据时始终遵循企业的隐私政策和数据保护制度[2]。

19. 及时响应和处理隐私泄露事件：

20. 建立应急响应机制，确保在发生隐私泄露事件时能够迅速采取措施，减少损失[2]。

21. 对用户报告的隐私问题进行及时回应和处理，增强用户对企业的信任度[2]。

通过以上措施，医疗器械生产企业可以更有效地确保支气管CT影像处理软件的用户隐私保护，提升用户信任度和企业形象。同时，企业也需要密切关注相关法律法规的变化，及时调整和完善隐私保护措施，以确保合规经营和用户权益的保障。